Tout commence lorsque Shouko Nishimiya intègre en cours d'année la classe de primaire de Shouya Ishida.
Pour Shoya, devenu le nouveau souffre-douleur de sa classe, rien ne change après le départ de Shoko.
Cinq ans après leur dernière rencontre, Shoya parvient à retrouver Shoko.
Si les retrouvailles de Shoko et de Miyoko se passent à merveille, au grand soulagement de Shoya...
Rattrapé par son passé après une conversation avec Satoshi, Shoya voit son pire cauchemar se réaliser...